Construida a finales del siglo XVII, Flaugergues es una de las numerosas residencias de la campiña de Montpellier conocidas como «follies». Estas «casas en el follaje» fueron construidas por una nueva aristocracia adinerada al servicio del rey. Situadas en plena campiña, estaban rodeadas de magníficos jardines. Se convirtieron en las residencias de verano de los notables de Montpellier en el siglo XVIII.
En 1696, Etienne de Flaugergues, consejero del Tribunal de Cuentas de Montpellier, adquirió una finca a la que dio su nombre. A lo largo de 45 años, amplió y embelleció esta «casa de campo» hasta darle su aspecto definitivo. Parece ser que el uso y la disposición del lugar donde se construyó Flaugergues, sus jardines y la calidad sencilla y meticulosa de sus edificios, sirvieron de modelo para muchas de las «locuras» de la región.
En 1811, Flaugergues se convirtió en una de las residencias de recreo de la familia Boussairolles, propietaria del castillo vecino.